Details of Metabolite (Meta)
The epigenetic modification information of this metabolite | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Modification Type | Molecule | EM Info | Cell/Tissue Type | Modified sites | Condition | REF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Methylation | AT1b | EM Info | Inflammatory cells | Genbank:U01033 277-1454 | Hypertension | [1], [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Methylation | DNMT1 | EM Info | HUVECs | . | . | [3], [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Methylation | DNMT3A | EM Info | Smooth muscle cells | . | . | [5], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Demethylation | Foxp3 | EM Info | Treg cells | Promoter | Adoptive transfer colitis | [7], [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Methylation | TFAM | EM Info | Smooth muscle cells | promoter: 210 bp and30 bp | . | [5], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Acetylation | H3 | EM Info | THP-1 cells | TNF-Alpha promoter | Inflammation | [7], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Acetylation | H3 | EM Info | THP-1 cells | IL-6 promoter | Inflammation | [5], [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Methylation | H3K27 | EM Info | THP-1 cells | IL-6 promoter | Inflammation | [7], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Methylation | H3K27 | EM Info | THP-1 cells | TNF-Alpha promoter | Inflammation | [7], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Dimethylation | H3K4 | EM Info | . | promoter | Intestinal diseases | [8] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Methylation | H3K9 | EM Info | THP-1 cells | IL-6 promoter | Inflammation | [7], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Methylation | H3K9 | EM Info | THP-1 cells | TNF-Alpha promoter | Inflammation | [7], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Deacetylation | HDAC | EM Info | THP-1 cells | . | Inflammation | [7], [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Deacetylation | SIRT1 | EM Info | A549 cells | . | Mitochondrial dysfunction | [9], [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Histone Deacetylation | SIRT3 | EM Info | Cardiomyocytes | . | Myocardial hypertrophy | [9], [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA | miR-126-3p | EM Info | HUVECs | . | . | [3], [4] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA | miR-129 | EM Info | Glomerular endothelial cells | . | Hypertension | [9], [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA | miR-194 | EM Info | Glomerular endothelial cells | . | Genetic diabetic kidney | [9], [2] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA | miR-455 | EM Info | BEAS-2B cells | . | Hypoxic injury | [9], [4] |
The microbes that produce this metabolite | |||||||
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Desulfovibrio piger | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[3], [4] | |||||
Description |
Desulfovibrio piger is an SRB from the Proteobacteria phylum (deltaproteobacteria) and formerly known as Desulfomonas pigra, is a gram-negative, nonmotile, rod-shaped bacteria.
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Desulfovibrio piger ATCC 29098 | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[5], [2] | |||||
Description |
Desulfovibrio piger ATCC 29098 is a strain of nanaerobic, gram-negative, only anaerobic respiration with sulfate as electron acceptor, non fermentative, asaccharolytic metabolism bacteria.
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Desulfovibrio sp. 3_1_syn3 | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[5], [2] | |||||
Description |
Desulfovibrio sp. 3_1_syn3 is a species of nanaerobic, gram-negative, only anaerobic respiration with sulfate as electron acceptor, nonfermentative, asaccharolytic metabolism bacteria.
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Desulfovirio spp. | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[8], [5] | |||||
Description |
Desulfovibrio is a genus of gram-negative sulfate-reducing bacteria.
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Bilophila wadsworthia | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[5], [10] | |||||
Description |
Bilophila wadsworthia is a gram-negative anaerobic rod. This bacteria carries out fermentation within the gut using taurine as the final electron acceptor. It is urease-positive, bile resistant, catalase-positive. It is largely found in patients that have appendicitis.
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Desulfovibrio | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[5], [11] | |||||
Description |
Desulfovibrio is a genus of gram-negative sulfate-reducing bacteria.
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Curtobacterium flaccumfaciens | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[5], [12] | |||||
Description |
Curtobacteria flaccumfaciens is a gram-positive aerobic bacteria from the genus Curtobacteria.
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Campylobacter fetus | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[5], [13] | |||||
Description |
Campylobacter fetus is a rod-shaped, gram-negative species of bacteria within the genus Campylobacter of phylum Proteobacteria.
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Bilophila spp. | |||||||
Detailed Information |
MIC Info
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[8], [5] | |||||
Description |
Bilophila is a gram-negative anaerobic bacteria that belongs in the Proteobacteria phylum.
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